Scopul principal al cercetărilor Institutului - asigurarea dezvoltarii inovationale
a sectorului zootehnic, prin:  

• Valorificarea potentialului genetic la animale agricole, definirea procesului de transformare şi trecere a acestuia de la o generatie la alta pentru crearea si ameliorarea raselor si tipurilor de taurine, ovine, iepuri de casă şi albine cu performante productive deosebite
• Elaborarea metodelor eficace de alimentatie si preparare a nutreturilor pentru animale
• Elaborarea şi experimentarea reţetelor noi de premixuri si adaosuri mineralo-vitaminice pentru animale si pasari de diferite vîrste si categorii fiziologice  
• Elaborarea metodelor si remediilor noi de asanare, profilaxie si tratare a maladiilor la animalele de ferma
• Elaborarea cerintelor zooveterinare pentru proiectarea fermelor de taurine şi ovine